刘文斌

教授/Professor

广州大学 计算科技研究院

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个人简介

博士、教授,博士生导师,广州大学计算科技研究院,广州大学“百人计划”引进学科带头人,入选浙江省杰出青年基金获得者,浙江省中青年学科带头人。主要研究领域包括生物计算,DNA存储,系统生物学,数据挖掘,大数据等。近年来主持完成四项国家基金、二项省基金、一项博士后基金。作为主要完成人和参与人获得省部级奖励三项,厅级奖励三项。累计在国内外重要期刊杂志和会议发表学术论文共发表论文50余篇,其中SCI,EI光盘检索30余篇。出版专著《DNA计算中的编码方法》(清华大学出版社)和译著《基因组信号处理》(科学出版社),参编《系统生物学》(浙江大学出版社)。担任IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics;Biosystems, Current Bioinformatics, Journal of Biology Systems,电子学报、系统仿真学报,生物数学学报等期刊审稿人。担任国家自然科学基金委、北京市、浙江省及山东省自然科学基金委等项目同行评审专家。

主要经历

1989年9月~1993年7月 华北电力学院本科

1993年9月~1996年4月 东南大学 硕士研究生

 1996年5月~2001年2月 西北电力设计院 工程师

2001年3月~2004年4月 华中科技大学 博士研究生

2004年10月~2006年10月华中科技大学博士后研究

2004年4月~2018年9月 温州大学

2007年1月~ 2008年2月 Institute for Systems Biology访问学者

2013年9月~ 2014年8月 Texas A&M University访问学者

2018年9月~至今 广州大学 

主要教学科研项目

1. 基于模板框方法的DNA计算中的编码问题研究(2004036130),中国博士后科学基金(二等)(2004-2006)2万

2. 研究DNA计算编码理论的一种新方法-模板框方法(60403002),国家自然科学基金,(2005-2007)24万

3 基于分子信标的DNA计算模型研究(Y105654),浙江省自然科学基金,(2006-2007)6万

4.复杂生物网络集中的频繁模式挖掘技术研究(省杰出青年基金项目:R1110261)(2011-2014),40万

5. 概率布尔网络长程相关性的相关理论及应用研究(国家基金项目:60970065)(2010-2012),32万

6. 临界基因调控网络的可控性理论及其干预方法研究(国家基金项目,61272018 ),(2013-2016)61万

7. 基因调控网络的鲁棒结构干预研究(国家基金项目, 61572367),(2016-2019)66万

著作专利

(1) 刘文斌、高琳翻译,《基因组信号处理》,科学出版社,2010

(2)朱翔鸥,刘文斌,《DNA计算中的编码方法》,清华大学出版社,2012. 

(3)林标杨,《系统生物学》,浙江大学出版社,2012(参编第九章)

(4)软件著作权:生物网络集中的频繁模式挖掘(V1.0),2011SR085661

(5)软件著作权:基于图元向量的差异网络分析软件(V1.0),2013SR055076

(6)发明专利:一种基于约束性布尔网络的最大评分预测方法,ZL201310457138.X

(7) 发明专利:基于布尔网络吸引域模拟干预肿瘤细胞状态的方法,ZL201610781378.9

教学科研获奖

(1) 优化计算中若干理论及其应用的研究,教育部自然科学一等奖,2004,排名第八。

(2) 图论与仿生计算中若干理论、应用及相互关系的研究,湖北省自然科学二等奖,2005,排名第五

(3)图与仿生计算理论及应用的研究,山东省高等学校优秀科研成果二等奖,2005,排名第二

(4) DNA计算模型及应用研究,浙江省高等学校优秀科研成果二等奖,2007,排名第一

(5) 生物大分子的构象及其在DNA计算中的应用研究,浙江省高等学校优秀科研成果三等奖,2011,排名第二

(6)可扩展高性能计算若干基础理论与方法,湖南省自然科学二等奖,2012,排名第三

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