学习报告:使用深度学习算法进行脑机接口的多模态 fNIRS-EEG 分类

本篇学习报告的内容为:使用深度学习算法进行脑机接口的多模态 fNIRS-EEG 分类,所参考的文献是《Multimodal fNIRS-EEG Classification Using Deep Learning Algorithms for Brain-Computer Interfaces Purposes》,该文献发布时间为2020年。文献使用了柏林科技大学的两个开源元数据集,研究了DNNs在多模态fNIRS-EEG记录的运动想象(MI)和精神负荷(MWL)任务分类中的能力。

 

 1 背景与研究内容

          单模态的脑电图(EEG)和单模态的功能性近红外光谱(fNIRS)已广泛用于脑成像。然而,近年来,这两种模态的融合在神经成像方面也显示出良好的结果,这是因为它们在时间和位置上准确识别大脑活动的分辨率,同时,由于EEG的时间分辨率高,空间分辨率低,而fNIRS的空间分辨率高,时间分辨率低,因此这两种模态之间会形成一种互补的特性,从而能够获得更加丰富的大脑信息。然而,基于fNIRS和EEG的认知任务分类涉及到复杂的模式识别问题,传统的分类方法需要先验的特征选择和预处理的工作,但是这并不能保证得到最优的分类。深度神经网络(DNN)可以克服这一挑战,DNNs直接从fNIRS和EEG信号中提取特征,并且大量的特征预处理工作。此外,随着计算能力的提高,DNN已成为高精度分类的实用选择。

 

2 数据集与信号处理

        文献研究使用了由Jaeyoung Shin等人于2016年和2017年在柏林科技大学收集的两个开源元数据集[2, 3]。两个数据集都包括了同时采集的脑电(30个通道)和fNIRS(36个通道)记录的大脑信息。此数据集记录了26名健康受试者在3个认知任务:(1)n-back(0-, 2-和3-back),歧视/选择反应任务(DSR)和单词生成任务(WG)中的大脑活动情况。第一个任务分别被分为四类(0-,2-和3-back任务和休息),第二个任务被分为两类(目标vs.非目标),第三个任务被两类(基线和单词生成)。第二个数据集是运动想象,包括左、右运动想象任务,共29名健康参与者。

        脑电电极按5-10系统分布于整个头皮。数据集在MWL实验中,分别在额叶区(16个通道)、运动区(4个通道)、顶叶区(4个通道)和枕叶区(4个通道)放置16个光源和16个探测器。而在MI实验中,15个信号源和16个fNIRS探测器分别放置在前额区(9个通道)、运动区(12个通道)和视觉区(3个通道)。在[2]和[3]中,第一和第二数据集头皮上的EEG和fNIRS通道有211个。数据集的具体描述如下:

数据集1. A: n-back -数据集由9个序列的0-,2-和3-back任务平衡顺序排列组成。单轮系列流程包括一个2秒的指令,显示任务类型(0-,2-或3-back),一个40秒的任务周期,和一个20秒的休息周期[3]。

数据集1. B: DSR -数据集由9个DSR系列组成,按平衡顺序排列。一个单独的试验包括2秒的指令,40秒的任务期和20秒的休息期。在任务期间,符号O和符号X以随机的顺序每隔2秒给出一次。当符号O出现时,被试按下一个按钮(目标,当符号X出现时按下另一个按钮(非目标)[3]。

数据集1. C: WG -每个系列包括20个随机顺序的单词生成(WG)和基线(BL)试验(每个10个)。对于WG,在2s指令中,要求被试继续思考已经给定开头字母的单词,而在BL中,要求被试放松并注视十字符号,以降低认知负荷[3]。

数据集2 .A:左手MI vs.右手MI -实验包括3个阶段的左手MI和右手MI,每个阶段包括1分钟的实验前休息时间,20个重复给定的任务,和1分钟的实验后休息时间。任务以2秒的视觉介绍开始,接着是10秒的任务周期和15 - 17秒的随机休息周期。被试被要求以1hz的速度[3]想象握(张开和握紧他们的手)。

       所有数据集的试验次数、系列数和实验次数的汇总见表1。

 

表1 实验规格摘要:所有数据集的试验次数、系列数和实验次数

 

3深度神经网络与输入特征

文献提出的深度神经网络由4个隐含层组成,如图1所示,每层包含60个神经元。输入层神经元数量为HbO/HbR和EEG通道数之和。输出层由两个、三个或四个单元组成,这个取决于实验中类的数量,同时soft-max激活表示类上的概率分布。这个架构是在试验了几种不同的架构(窄的和宽的)后选择的。

 

图1  拟建DNN的规格。DNN由四个隐藏层组成,每层有60个神经元。输出层由两个、三个或四个单元组成,这取决于实验中的班级数量,同时soft-max激活表示类上的概率分布。

 

DNN的输入特征被定义为N个样本,每个样本包含所有通道在所选时间窗口内的ERD、DHbODHbR 的平均值。N的值取决于时间窗口的长度。由于fNIRS采样率低,数据集相对较小,必须谨慎选择窗口。所选择的窗口长度既不应该导致N足够小以至于发生过拟合,也不应该窗口太大以至于影响精度。为了确保这一点,文献选择了3s的窗口长度。输入的特征数量根据所使用的采集数据点数量而有所不同。对于完全混合的fNIR-EEG,一个样本有102个(36 + 36 + 30)特征。为了比较完全混合的fNIRS-EEG系统与独立的fNIRS和EEG的分类精度,文献还测试了另外四种情况:融合的EEG和DHbO、单模态的EEG、DHbODHbR的融合,以及单模态的DHbO。对应于这些情况中每一种的特征的数量如表2所示。

表2. 调查的每个场景的功能数量

分类流程如图2所示。滤波后,将之前获得的fNIRS特征进行平方,然后在滑动窗口上求平均,以计算DHbRDHbO。此外,在滤波之后,对之前获得的EEG信号特征在滑动窗口上进行平均,并对结果进行ERD/ERS分析。然后,所有特征被馈送到DNN算法来进行网络的训练。

 

图2 分类流程:在滤波之后,将之前获得的fNIRS特征进行平方,然后在滑动窗口上求平均,以计算DHbRDHbO。此外,在滤波之后,将之前获得的EEG信号特征在滑动窗口上进行平均,并对结果进行ERD/ERS分析。然后,所有特征被馈送到DNN算法来进行网络的训练。

 

4 结果

表3-6分别报告了n-back、DSR、WG和MI任务中所有记录组合(EEG、fNIRS (DHbO - DHbR)、fNIRS (DHbO)、EEG + fNIRS (DHbO - DHbR)和EEG + fNIRS (DHbO - DHbR))基于DNN分类和基于SVM分类的单被试准确率。计算了26名被试在脑力负荷任务和29名被试在MI任务中的平均准确率。 

 

表3 单被试和平均分类性能,n-back任务

 

对于所有事件,与独立方法相比,全混合EEG-fNIRS具有最高的平均准确性。在所有的实验中,采用DNN作为分类器的效果都优于传统的SVM分类器。DSR任务的改进率最高,为8%。总体而言,2类实验(MI、DSR和WG)的平均分类准确率高于4类n-back测试,正如预期的那样,因为n-back测试中可能存在的类更多。所提出的DNN分类器对WG任务的准确率为92%,而SVM的准确率为86%。

使用ELU激活函数生成表中所示的结果。为了研究激活函数对分类性能的影响,文献应用了两个最近引入的激活函数,并比较了它们在这个应用中的性能。应用的激活函数是整流线性单元(ReLU)函数,该函数已被证明可以抑制由于其非饱和性质而导致的消失梯度问题,以及指数线性单元(ELU),该函数的代价快速收敛到零[6]。使用ELU激活函数时,分类准确率平均比使用ReLU时高2%。

 

表4 单被试和平均分类性能,DSR

 

所有实验的混淆矩阵如图3所示。这些矩阵的行代表预测条件标签,而列代表参考标签。在所有的实验中,在所有的个体类别中都取得了显著的成绩,并且在混淆矩阵(对角元素,深棕色)中获得了显著的和正确的识别。在n-back测试中,3-back类相对于其他类具有最高的真正分类,2-back类具有最低的真正分类。3-back和2-back的试验显示出最严重的错误分类,3-back被归类为2-back,反之亦然。错误分类的模式表明,当项目被错误分类时,他们更有可能与难度相近的项目相混淆。在MI测试中,右手动作的解码性能较好,左手动作的真阳性分类最小。在两类实验中进行分类比四类实验产生更高的整体准确率。在WG和DSR中,两类都有相似的真阳性分类率,而误分类在两类中几乎相同。

 

表5 单被试和平均分类性能,WG

 

 表6 单被试和平均分类性能,MI

 

图3所示 所有实验的混淆矩阵

 

 

5 总结与思考

文献研究了DNN结构在混合EEG-fNIRS的MI和MWL任务分类中的结果表现。文献结果表明,与单模态的EEG或fNIRS记录相比,多模态的分类精度要高得多。与传统的SVM相比,该算法显著提高了分类性能,对MI任务的平均准确率达到90%,比SVM高出8%。对于n-back任务,提出的DNN达到87%的准确率,而使用SVM的准确率为82%。选择ELU激活函数是因为它相对于ReLU具有更高的准确性。文献的结果证明了使用多模态BCI和全连接DNN实现强分类性能的可行性。

文献的全连接DNN方法对EEG和fNIRS 的多模态生理信号实现了高精度分类的效果。但此文献的方法只应用在公开数据集上,因此此方法可以在日后不同应用(如情绪分类,意识检测,虚拟现实等)的EEG-fNIRS多模态生理信号中进一步尝试应用并且改进。

 

6 参考文献

[1] Saadati M , Nelson J , Ayaz H . Multimodal fNIRS-EEG Classification Using Deep Learning Algorithms for Brain-Computer Interfaces Purposes[M]. 2020.

[2] Shin, J., Von Luhmann, A., Kim, D.-W., Mehnert, J., Hwang, H.-J., Muller, K.-R.:

Simultaneous acquisition of EEG and NIRS during cognitive tasks for an open access

dataset. In: Generic Research Data (2018)

[3] Shin, J., Von Lhmann, A., Kim, D.-W., Mehnert, J., Hwang, H.-J., Muller, K.-R.:

Simultaneous aquisition of EEG and NIRS during cognitive tasks for an open access dataset. In: Scientific Data, vol. 5 (2018)

 

撰稿人:钟泳诗

导师:邱丽娜老师


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