21级硕士生孙典正同学的工作被《Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences》录用
来源: 孙战里/
安徽大学
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2024-01-12

长链非编码RNAlncRNA)发挥着调节基因表达过程的作用,同时其生物活动也与癌症等疾病有关。LncRNA与蛋白质相互作用是lncRNA发挥其生物调控作用的方式之一。研究lncRNA与蛋白质相互作用关系能帮助人们更好地理解lncRNA在生物活动中的作用。针对这一研究方向,21级硕士生孙典正同学提出了一种使用分段k-mer编码和多空间聚类的深度学习方法,处理正负样本不平衡情况下的lncRNA与蛋白质的相互作用关系预测问题。消融实验和可视化结果证明了该方法的优越性。

2023125日,相关研究工作,“LPI-SKMSC: Predicting LncRNA–Protein Interactions with Segmented k-mer Frequencies and Multi-space Clustering”,被《Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences》录用。该期刊是生物医学和人工智能交叉学科的学术性刊物,主要刊载生物信息学、计算生物物理及化学、医学信息学等跨学科交叉的研究成果,2022年期刊影响因子是4.8,中科院SCI期刊分区中数学与计算生物学三区期刊。


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